第二季故事发生在笑脸男事件结束后，公安9课面对了新的敌人，自称“个人的11人”的反政府武装组织开始了计划周密的犯罪，其背后牵扯的战争难民问题更令整个社会的矛盾激化。面对政府与犯罪分子带来的压力，草薙素子再次带领公安9课出动。
攻壳机动队第二季－攻壳机动队 S.A.C. 2nd GIG剧集目录
01 再起动
02 饱食终日的我
03 周六夜晚与周日早晨
04 天敌
05 有动机的人们
06 潜在热源
07 狂想乃亡国之曲调
08 素食的晚餐
09 名为绝望的希望
10 愤怒的男人
11 草迷宫
12 至无名者
13 脸
14 注意左眼
15 机器们的午后
16 置身于此
17 修好的母子
18 天使之诗
19 相对的连锁
20 北端的混迷
21 败走
22 无人街
23 桥下的落日
24 出岛 空袭
25 往乐园的另一边
26 回归至忧国
